刺五加的药用部位是其根茎，亦称“刺五加根”。其根部在生长过程中形成多个细长的根茎，呈圆柱形，表面呈灰褐色或棕褐色，质地坚硬，断面呈白色或淡黄色，具有一定的药用价值。

刺五加作为一种传统中药材，广泛用于治疗多种疾病，其药效主要来源于其根茎中的活性成分，如皂苷、黄酮类化合物等。这些成分具有抗氧化、抗炎、免疫调节等作用，常用于增强机体免疫力、改善疲劳、缓解头晕、改善睡眠等。

在中医药理论中，刺五加被归为补气养血类药材，具有补中益气、养血安神的功效。常用于治疗体虚乏力、气血不足、精神不振、失眠多梦等症状。

根据《中华人民共和国药典》及中医药研究文献，刺五加的根茎具有良好的药理活性，其有效成分在实验中表现出抗疲劳、抗衰老、增强免疫力等作用。同时，其安全性较高，副作用较少，适合长期服用。

刺五加的药用部位为根茎，其在中医药中的应用广泛，具有显著的药理和临床价值。